De kleuren van de Mini American Shepherd zijn hetzelfde als van de Austrailian Shepherd . Er zijn 4 basis kleuren. Black, Blue-Merle, Red en Red-Merle. Naargelang het al dan niet hebben van een bepaalde aftekening, ontstaan er dan nog verschillende varianten.
Hieronder zie je de verschillende mogelijkheden.
Self Black 
Back Tricolor 
Black Bicolor 
Black Tan 
Self Blue Merle 
Blue Merle White & Tan 
Blue Merle White 
Blue Merle & Tan 
Self Red 
Red Tri Color 
Red BiColor 
Red & Tan 
Self Red Merle 
Red Merle White & Tan 
Red Merle WHite 
Red Merle & Tan